С помощью компьютерного моделирования специалисты ООО «Биокор Текнолоджи» оценили возможность своих диагностических наборов “Biocore® SARS-CoV-2” обнаруживать новый вариант корона вируса B.1.1.529 (Omicron).

Диагностические наборы для обнаружения «Biocore® SARS-CoV-2» производства ООО «Биокор Текнолоджи ЛТД» имеют многоцелевой дизайн (ORF1ab, N – гены). Для определения потенциального влияния известных мутаций производитель постоянно производит оценку своей продукции с помощью компьютерного моделирования (in silico assessment). Сравнительный анализ зон амплификации, используемых в наборах производства компании, показал отсутствие вариаций между нуклеотидными референтными последовательностями (Wuhan-Hu-1) и мутантного (B.1.1.529 Omicron) штаммов SARS-CoV-2. Таким образом, набор диагностический “Biocore® SARS-CoV-2” для обнаружения РНК коронавируса SARS-CoV-2 методом ОТ-ПЦР в реальном времени позволяет определять вариант B.1.1.529 (Omicron) без его детальной дифференциации.

Напомним, 26 ноября 2021 г. ВОЗ по рекомендации Технической консультативной группы по эволюции вируса SARS-CoV-2 (ТКГЭВ) объявила вариант B.1.1.529 вызывающим беспокойство и предоставила ему наименование «Омикрон». Решение было принято на основе представленных ТКГЭВ фактических данных о том, что вариант «Омикрон» имеет несколько новых мутаций, которые могут повлиять на его свойства, в частности на его способность к распространению или тяжесть вызываемого им заболевания. Также данные мутации могут оказать существенное влияние на диагностические характеристики диагностикумов, используемых для определения SARS-CoV-2.

Подробнее о новом варианте коронавируса

Вариант SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) относится к линии поколений B.1.1 и характеризуется 30 аминокислотными заменами, тремя небольшими делециями и одной небольшой инсерцией в спаечном (S) белке по сравнению с оригинальным вирусом (Wuhan-Hu-1) ): A67V, Δ69-70, T95I, G142D, 446K Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F. Он также несет ряд аминокислотных замен и делеций в других элементах генома: ORF1ab (K38R, V1069I, Δ1265, L1266I, A1892T, T492I, P132H, Δ105-107, A189V, P323L, I42 поверхностный белок (T9I); мембранный белок (D3G, Q19E, A63T); нуклеокапсидный белок (P13L, Δ31-33, R203K, G204R).

Тест-система доступна для заказа у официальных дистрибьюторов:

Департамент молекулярной и клеточной биологии (ООО АЛТ Украина) – +380 (44) 492-72-70
Отдел молекулярной биологии и генетики (ООО ХИМЛАБОРРЕАКТИВ) – +380 (44) 494 42 42
Отдел продаж (ООО МЕДЛАБГАРАНТ-ИФ) – +380 (50) 645-66-58