Вирусные гепатиты поражают миллионы людей и связаны со значительной летальностью. Анализ с помощью мультиомики считается ключевым в ведущей клинической медицине, он включает преимущественно геномику, транскриптомику, протеомику, метаболомику.
Данная статься — это короткие урывки, где мы приводим несколько примеров недавних применений мультиомики для разных типов вирусных гепатитов. Полноценную статью в оригинале вы можете прочесть по ссылке.
Вирус гепатита A(HAV)
Вспышки HAV часто связаны с плохими санитарными условиями, перенаселенностью или загрязнением пищи и воды (Abutaleb and Kottilil, 2020). Инфекции HAV у детей обычно протекают бессимптомно, но у взрослых симптомы проявляются у желтухи, боли в жизни и гипербилирубинемии.
Heydari et al. (2021) провели полногеномное секвенирование пациентов с острым гепатитом А и построили HAV-филогенетическое дерево. Liang et al. (2020) обнаружили, что интерферон типа I играет очень важную роль в патогенетическом механизме DHAV-3. Были идентифицированы и протеины, задействованные в DHAV-1 инфекционном процессе (Lan et al., 2019).
Читайте также: Эволюция знаний о гепатите А (посилання на статтю про еволюцію)
Вирус гепатита В(HBV)
Вирус гепатита B является распространенной причиной острых и хронических заболеваний заболевания во всем мире. Ежегодно около 4 миллионов человек инфицируются HBV, особенно в Азии и Африке. В около 10% зараженных, инфицированных HBV, развиваются хронические инфекции, включая фиброз и цирроз печени.
Мультимиомика при HBV:
- Guzmán-Solis et al. (2021) предположили, что HBV может происходить с Африканского континента.
- Ramirez et al. (2021) описали структуру и транскрипционные признаки интегрированного HBV в разные HCC клеточные линии.
- Péneau et al. (2022) обнаружили два механизма, связанных с клональной селекцией для интегрирования HBV.
- Zeyen et al. (2020)изучали оболочковый протеиновый комплекс II.
- Zhao et al. (2020) обнаружили, что высокая экспрессия S100 протеинов связана с передачей HBV в плаценту.
- Zai et al. (2022) показали, что долгосрочная HBV инфекция приводит к изменению клеточного протеома
- McBrearty et al. (2021) изучали прогрессирование CHB в гепатоцеллюлярную карциному (HCC).
- Ye et al. (2020) установили РНК, эффективно регулирующие HBV-связанные фиброзы.
- Wu D. et al. (2020) установили, что плазминоген можно использовать в качестве прогностического маркера для HBV-ACLF.
- Sun et al. (2019) выявили гематологическую дисфункцию пациентов с HBV-ACLF и установили диагностическую и прогностическую модель для острых вирусных гепатитов.
- Lin et al. (2022) построили LGPI модель для HBV-связанной HCC.
- Gao et al. (2019) определили два HCC прогностических маркера.
- Yu et al. (2022) изучали влияние на патогенез HBV инфекции.
- Hu et al. (2021) исследовали влияние на регуляцию антивирусного ответа хозяина к HBV.
- Nguyen et al. (2021) выявили некоторые факторы влияния на прогрессирование пациентов с CHB.
- Sun et al. (2021) изучали пути метаболизма желчных кислот у людей с CHB.
И это далеко не все исследования гепатита В.
Вирус гепатита C(HCV)
Вирионы вируса гепатита С являются сферическими и представляют собой одноцепочечные вирусы положительной РНК. HCV часто может вызвать инфекцию гепатита С. По оценкам, примерно 71 миллион людей во всем мире страдают хронической инфекцией, вызванной вирусом гепатита С (Rabaan et al., 2020).
Takagi et al. (2021) занимались секвенированием мышиной сыворотки и изучали инфекционное клонирование. Malov et al. (2021) обнаружили некоторые HCV-связанные HCC маркеры. Shanmuganathan et al. (2021) занимались исследованием характеристик сывороточных метаболитов. Sodroski et al. (2019) составили комплексную карту связей HCV-miRNA.
Применение мультиомики помогает исследователям глубже понять HCV и связанные с ним заболевания.
Вирус гепатита D(HDV)
Это сателлитный вирус, который собирается, высвобождается и попадает в белок HBV. Это самый маленький известный РНК-вирус, кодирующий один белок.
Chang и другие. (2019) обнаружили уникальность HDV-HBV связи для человека.
Вирус гепатита E(HEV)
Вирус гепатита Е (HEV) является важным зоонозным вирусом, который может инфицировать разных хозяев и имеет 7 основных генотипов.
Wu et al., (2022) обнаружили, что дисбактериоз кишечной микрофлоры связан с плазменными уровнями интерферона-γ и вирусной нагрузкой у пациентов с острым гепатитом E. Также было продемонстрировано, что динамические изменения в метаболитах сыворотки были связаны с инфекцией острого гепатита Е.
Заключение
В заключение можно сказать, что применение мультиомики продемонстрировало происхождение и развитие вирусов гепатита и обеспечило новые стратегии диагностики, прогноза и лечения острых вирусных гепатитов и связанных с ними заболеваний.